L'accentuation des pentes vers l'est, associée à une élévation de l'altitude moyenne des vallées, amène un étagement plus net de la végétation dans la partie bigourdane de l'espace Parc. De fait, si la limite des différents étages est 200m plus haut en soulane sur l'ensemble de l’espace Parc, on note une montée en altitude de tous les étages de végétation d'ouest en est d'environ 150 à 200m. Localement, les conditions climatiques sont fortement influencées par les formes du relief;des effets d'inversion de température, de thermiques locaux, de lentilles froides ou d'expositions très favorables entraînent des conditions écologiques particulières - stations abyssales ou méditerranéennes - expliquant la présence relictuelle d'espèces particulières.

Les variations de pente influent sur les conditions de drainage, d'érosion et de colluvionnement et sur le déclenchement des éboulements ou avalanches, qui conditionnent les possibilités d'implantation des activités humaines et des végétaux et animaux. Les difficultés d'accès aux forêts selon la pente ont ainsi contribué au développement de forêts subnaturelles par suite de leur faible ou non exploitation, les prés de fauche de moyenne montagne (plus de la moitié des terrains en zone périphérique) étant de plus en plus délaissés faute de mécanisation possible. L'abondance des falaises et des zones très pentues et la présence de grandes zones herbacées ou d'éboulis en haute altitude offrent par contre de larges possibilités d'implantation à de nombreuses espèces de rapaces notamment, mais aussi contribuent au maintien d'espèces végétales dont de nombreuses endémiques.

Cloisonnement des vallées, diversité des conditions structurales, rigueur des conditions climatiques dues à la vigueur des pentes et expositions, tous ces éléments, associés aux effets de la géologie et de la géomorphologie, sont autant de facteurs de biodiversité.